Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan (FPIK) Universitas Diponegoro (Undip) berawal dari pembentukan Jurusan Perikanan pada Fakultas Peternakan melalui SK Rektor No. 44/1968 pada 8 Oktober 1968. Setelah beberapa perubahan nama dan struktur, termasuk menjadi Fakultas Peternakan dan Perikanan pada 1978 dan kembali menjadi Fakultas Peternakan pada 1982, pengembangan Program Studi Ilmu Kelautan dimulai pada 1985 bersama lima perguruan tinggi lainnya di Indonesia. Program Studi Ilmu Kelautan resmi berdiri di Undip pada 1987 berdasarkan SK Dirjen Dikti, dengan pengelolaan administratif di bawah Fakultas Peternakan dan aspek akademik dikoordinasi langsung oleh rektorat. Akhirnya, FPIK resmi berdiri sebagai fakultas mandiri pada 25 Juli 1994 melalui SK Mendikbud RI No. 0181/0/1994, mencakup dua jurusan: Perikanan dan Ilmu Kelautan.