Fakultas Peternakan dan Pertanian Universitas Diponegoro (FPP UNDIP) didirikan pada 1 September 1964 berdasarkan SK Menteri PTIP Nomor 75/1964, berawal dari potensi besar peternakan di Jawa Tengah. Awalnya bernama Fakultas Peternakan, fakultas ini mengalami berbagai perkembangan, termasuk pembukaan jurusan perikanan pada 1968 hingga berubah menjadi Fakultas Peternakan dan Perikanan pada 1974. Dengan berdirinya Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan pada 1994, fokus kembali pada jurusan peternakan. Pada 2012, fakultas ini resmi menjadi Fakultas Peternakan dan Pertanian dengan penggabungan jurusan dan pembentukan Jurusan Pertanian, seiring upaya efisiensi dan pengembangan program studi.