Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) Universitas Diponegoro resmi berdiri pada 21 Oktober 1993 berdasarkan SK Mendikbud No. 0369/0/1993, setelah sebelumnya berada di bawah Badan Pengelola MIPA (BP-MIPA). Fakultas ini berawal dari Program Studi Matematika yang dibuka sejak 1969 dan berkembang dengan penambahan Program Studi Biologi, Kimia, dan Fisika pada 1988, yang kemudian menjadi jurusan di bawah FMIPA pada 1993. Jurusan Matematika memiliki tiga program studi, yaitu Matematika, Statistika, dan Teknik Informatika, didukung oleh berbagai laboratorium dan riset unggulan di bidang komputasi, sistem kontrol, optimasi, serta teknologi informasi. Jurusan Fisika, Biologi, dan Kimia juga berkembang menjadi bagian penting dari FMIPA berdasarkan berbagai SK resmi, dengan fokus pada pengembangan akademik dan penelitian.