Direktorat
- Direktorat Akademik
- Direktorat Kemahasiswaan dan Alumni
- Direktorat Keuangan, Akuntansi dan Perpajakan.
- Direktorat Aset dan Perancangan
- Direktorat Sumber Daya Manusia
- Direktorat Sistem dan Teknologi Informasi
- Direktorat Hukum dan Organisasi
- Direktorat Inovasi, Hilirisasi dan Kerja Sama
- Direktorat Reputasi, Kemitraan dan Konektivitas Global
- Direktorat Jejaring Media, Komunitas dan Komunikasi Publik
Lembaga dan UPT
- UPT Laboratorium Terpadu
- UPT Perpustakaan dan Undip Press
- UPT Keselamatan, Kesehatan Kerja dan Lingkungan (UPT K3L)
- UPT Layanan Konsultasi, Disabilitas, Penegakan Disiplin dan Etika Mahasiswa
- UPT Layanan Seni, Budaya dan Olahraga
- Lembaga Pengembangan dan Penjaminan Mutu Pendidikan (LP2MP)
- Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (LPPM)
Sumberdaya Universitas
- Kantor Kawasan Hutan dengan Tujuan Khusus (KHDTK)
- Kantor Kearsipan
- Kantor Pengadaan Barang dan Jasa
- Kantor Prestasi dan Fasilitasi Bisnis Mahasiswa
